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Citation
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Features
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</nav>
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</li>
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Change Log
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Citation
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@ -696,6 +696,60 @@
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Visualizations
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Data Quality
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Features
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</li>
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@ -705,14 +759,14 @@
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Developers
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Developers
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@ -833,14 +887,14 @@
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@ -900,6 +954,18 @@
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Change Log
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Citation
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@ -696,6 +696,60 @@
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Data Quality
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Features
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@ -705,14 +759,14 @@
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Developers
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@ -890,14 +944,14 @@
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@ -957,6 +1011,18 @@
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Change Log
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</li>
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Citation
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|
@ -706,11 +706,65 @@
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Visualizations
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|
||||
Data Quality
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</li>
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|
||||
Features
|
||||
</a>
|
||||
</li>
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||||
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</ul>
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</nav>
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</li>
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Developers
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|
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Developers
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</label>
|
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|
@ -795,14 +849,14 @@
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Others
|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
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|
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|
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|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
|
||||
|
@ -977,6 +1031,18 @@
|
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<li class="md-nav__item">
|
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|
||||
Change Log
|
||||
</a>
|
||||
</li>
|
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|
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<li class="md-nav__item">
|
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|
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@ -780,11 +780,65 @@
|
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Visualizations
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Visualizations
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Data Quality
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Features
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</nav>
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Change Log
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Citation
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Next
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Remote Support
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Data Quality
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Data Quality
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Features
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</ul>
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</nav>
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Developers
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Developers
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@ -860,14 +914,14 @@
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Others
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@ -927,6 +981,18 @@
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Change Log
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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Visualizations
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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Data Quality
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||||
Features
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Developers
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Developers
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</label>
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@ -835,14 +889,14 @@
|
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Others
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</label>
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@ -902,6 +956,18 @@
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Change Log
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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|
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Citation
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||||
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@ -748,11 +748,65 @@
|
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|
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|
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Visualizations
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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Data Quality
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|
||||
Features
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||||
</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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||||
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Developers
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Developers
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</label>
|
||||
|
@ -835,14 +889,14 @@
|
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|
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Others
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</label>
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||||
|
@ -902,6 +956,18 @@
|
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|
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|
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Change Log
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</a>
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||||
</li>
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<li class="md-nav__item">
|
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|
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Citation
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||||
|
|
|
@ -748,11 +748,65 @@
|
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|
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|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
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</label>
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|
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Data Quality
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</li>
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<li class="md-nav__item">
|
||||
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|
||||
Features
|
||||
</a>
|
||||
</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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||||
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|
||||
</label>
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|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
Developers
|
||||
</label>
|
||||
|
@ -835,14 +889,14 @@
|
|||
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|
||||
|
||||
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|
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|
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|
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|
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|
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Others
|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
||||
<nav class="md-nav" aria-label="Others" data-md-level="1">
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|
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<label class="md-nav__title" for="nav-7">
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
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Others
|
||||
</label>
|
||||
|
@ -902,6 +956,18 @@
|
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|
||||
<li class="md-nav__item">
|
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<a href="../../change-log/" class="md-nav__link">
|
||||
Change Log
|
||||
</a>
|
||||
</li>
|
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<li class="md-nav__item">
|
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<a href="../../citation/" class="md-nav__link">
|
||||
Citation
|
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|
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@ -748,11 +748,65 @@
|
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
|
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Change Log
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Citation
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Features
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@ -835,14 +889,14 @@
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Change Log
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Citation
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Data Quality
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Features
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</nav>
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Developers
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Developers
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@ -842,14 +896,14 @@
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@ -909,6 +963,18 @@
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Change Log
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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Data Quality
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Features
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@ -835,14 +889,14 @@
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@ -902,6 +956,18 @@
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Change Log
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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Visualizations
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Data Quality
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|
||||
Features
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</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Developers
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</label>
|
||||
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@ -835,14 +889,14 @@
|
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Others
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</label>
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||||
|
@ -902,6 +956,18 @@
|
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<li class="md-nav__item">
|
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<a href="../../change-log/" class="md-nav__link">
|
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Change Log
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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|
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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|
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|
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<label class="md-nav__link" for="nav-5">
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Visualizations
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
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</label>
|
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<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
|
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|
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Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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Change Log
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Features
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Developers
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Change Log
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@ -835,14 +889,14 @@
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Change Log
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Features
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</ul>
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</nav>
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</li>
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Developers
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</label>
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@ -835,14 +889,14 @@
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Others
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</label>
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||||
|
@ -902,6 +956,18 @@
|
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<li class="md-nav__item">
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Change Log
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</a>
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</li>
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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|
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|
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|
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|
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Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
|
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|
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Data Quality
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</a>
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|
||||
Features
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||||
</a>
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||||
</li>
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|
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</ul>
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</nav>
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Change Log
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Change Log
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Features
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Developers
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@ -835,14 +889,14 @@
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Change Log
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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</li>
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@ -835,14 +889,14 @@
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Change Log
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</ul>
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</nav>
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</li>
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Developers
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</label>
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@ -835,14 +889,14 @@
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
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||||
|
@ -902,6 +956,18 @@
|
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<li class="md-nav__item">
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Change Log
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</a>
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</li>
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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Data Quality
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|
||||
Features
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||||
</a>
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||||
</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
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</label>
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Developers
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</label>
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@ -835,14 +889,14 @@
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Others
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Others
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@ -902,6 +956,18 @@
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<li class="md-nav__item">
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Change Log
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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Citation
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@ -717,11 +717,65 @@
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Visualizations
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Visualizations
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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Data Quality
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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Features
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</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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<label class="md-nav__link" for="nav-6">
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Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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||||
Developers
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</label>
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||||
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@ -804,14 +858,14 @@
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-7" type="checkbox" id="nav-7" >
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Others
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
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@ -871,6 +925,18 @@
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../citation/" class="md-nav__link">
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Citation
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@ -929,7 +995,7 @@
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<p>RAPIDS source code is saved in <code>src/</code>. The <code>src/data/</code> folder stores scripts to download, clean and pre-process sensor data, <code>src/features</code> has scripts to extract behavioral features organized in their respective sensor subfolders , <code>src/models/</code> can host any script to create models or statistical analyses with the behavioral features you extract, and <code>src/visualization/</code> has scripts to create plots of the raw and processed data. There are other files and folders but only relevant if you are interested in extending RAPIDS (e.g. virtual env files, docs, tests, Dockerfile, the Snakefile, etc.). </p>
|
||||
<p>In the figure below, we represent the interactions between users and files. After a user modifies the configuration files mentioned above, the <code>Snakefile</code> file will search for and execute the Snakemake rules that contain the Python or R scripts necessary to generate or update the required output files (behavioral features, plots, etc.).</p>
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<figure>
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<img src="../img/files.png" width="600" />
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<img src="../img/files.png" max-width="100%" />
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<figcaption>Interaction diagram between the user, and important files in RAPIDS</figcaption>
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</figure>
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After Width: | Height: | Size: 37 KiB |
After Width: | Height: | Size: 46 KiB |
After Width: | Height: | Size: 288 KiB |
After Width: | Height: | Size: 58 KiB |
After Width: | Height: | Size: 53 KiB |
|
@ -758,11 +758,65 @@
|
|||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
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||||
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<label class="md-nav__link" for="nav-5">
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Visualizations
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
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<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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Data Quality
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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Features
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</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Developers
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</label>
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@ -845,14 +899,14 @@
|
|||
<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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||||
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||||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-7" type="checkbox" id="nav-7" >
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Others
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
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@ -912,6 +966,18 @@
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<li class="md-nav__item">
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<a href="change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="citation/" class="md-nav__link">
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||||
Citation
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@ -706,11 +706,65 @@
|
|||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
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<label class="md-nav__link" for="nav-5">
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||||
Visualizations
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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||||
</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
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||||
<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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||||
Visualizations
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</label>
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||||
<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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Data Quality
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../visualizations/feature-visualizations/" class="md-nav__link">
|
||||
Features
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</a>
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||||
</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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||||
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<label class="md-nav__link" for="nav-6">
|
||||
Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Developers" data-md-level="1">
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<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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<label class="md-nav__title" for="nav-6">
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||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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||||
Developers
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</label>
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||||
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@ -795,14 +849,14 @@
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|||
<li class="md-nav__item md-nav__item--active md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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||||
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||||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" checked>
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-7" type="checkbox" id="nav-7" checked>
|
||||
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<label class="md-nav__link" for="nav-6">
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<label class="md-nav__link" for="nav-7">
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Others
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
|
||||
<nav class="md-nav" aria-label="Others" data-md-level="1">
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||||
<label class="md-nav__title" for="nav-6">
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||||
<label class="md-nav__title" for="nav-7">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
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@ -871,6 +925,18 @@
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../citation/" class="md-nav__link">
|
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Citation
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@ -834,11 +834,65 @@
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
|
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<label class="md-nav__link" for="nav-5">
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Visualizations
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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||||
<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
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||||
<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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||||
Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../../visualizations/data-quality-visualizations/" class="md-nav__link">
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Data Quality
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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||||
<a href="../../visualizations/feature-visualizations/" class="md-nav__link">
|
||||
Features
|
||||
</a>
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||||
</li>
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||||
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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||||
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
|
||||
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||||
<label class="md-nav__link" for="nav-6">
|
||||
Developers
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
||||
<nav class="md-nav" aria-label="Developers" data-md-level="1">
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||||
<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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||||
<label class="md-nav__title" for="nav-6">
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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||||
Developers
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||||
</label>
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||||
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@ -921,14 +975,14 @@
|
|||
<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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||||
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||||
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||||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
|
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-7" type="checkbox" id="nav-7" >
|
||||
|
||||
<label class="md-nav__link" for="nav-6">
|
||||
<label class="md-nav__link" for="nav-7">
|
||||
Others
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||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
||||
<nav class="md-nav" aria-label="Others" data-md-level="1">
|
||||
<label class="md-nav__title" for="nav-6">
|
||||
<label class="md-nav__title" for="nav-7">
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
Others
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||||
</label>
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||||
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@ -988,6 +1042,18 @@
|
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<li class="md-nav__item">
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||||
<a href="../../change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../../citation/" class="md-nav__link">
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Citation
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@ -717,11 +717,65 @@
|
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
|
||||
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||||
<label class="md-nav__link" for="nav-5">
|
||||
Visualizations
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
||||
<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
|
||||
<label class="md-nav__title" for="nav-5">
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
|
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../../visualizations/data-quality-visualizations/" class="md-nav__link">
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Data Quality
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
|
||||
<a href="../../visualizations/feature-visualizations/" class="md-nav__link">
|
||||
Features
|
||||
</a>
|
||||
</li>
|
||||
|
||||
|
||||
</ul>
|
||||
</nav>
|
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</li>
|
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Developers
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Developers
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Developers
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Data Quality
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Features
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@ -795,14 +849,14 @@
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Citation
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@ -1277,13 +1343,13 @@
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Citation
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Change Log
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@ -774,11 +774,65 @@
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Visualizations
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Data Quality
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Features
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Developers
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Developers
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@ -861,14 +915,14 @@
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Others
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<a href="../../change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../../citation/" class="md-nav__link">
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Citation
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@ -1042,7 +1108,7 @@
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<p>The goal of this workflow is to find out if we can predict the daily symptom burden score of a participant. Thus, we framed this question as a binary classification problem with two classes, high and low symptom burden based on the scores above and below average of each participant. We also want to compare the performance of individual (personalized) models vs a population model. </p>
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||||
<p>In total, our example workflow has nine steps that are in charge of sensor data preprocessing, feature extraction, feature cleaning, machine learning model training and model evaluation (see figure below). We ship this workflow with RAPIDS and share a database with <a href="https://osf.io/skqfv/files/">test data</a> in an Open Science Framework repository. </p>
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<figure>
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<img src="../../img/analysis_workflow.png" width="600" />
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||||
<img src="../../img/analysis_workflow.png" max-width="100%" />
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<figcaption>Modules of RAPIDS example workflow, from raw data to model evaluation</figcaption>
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</figure>
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@ -717,11 +717,65 @@
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
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Visualizations
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
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<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../../visualizations/data-quality-visualizations/" class="md-nav__link">
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Data Quality
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../../visualizations/feature-visualizations/" class="md-nav__link">
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Features
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</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
|
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<label class="md-nav__link" for="nav-6">
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Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Developers" data-md-level="1">
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<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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<label class="md-nav__title" for="nav-6">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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||||
Developers
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||||
</label>
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||||
|
@ -804,14 +858,14 @@
|
|||
<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
|
||||
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||||
|
||||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
|
||||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-7" type="checkbox" id="nav-7" >
|
||||
|
||||
<label class="md-nav__link" for="nav-6">
|
||||
<label class="md-nav__link" for="nav-7">
|
||||
Others
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
||||
<nav class="md-nav" aria-label="Others" data-md-level="1">
|
||||
<label class="md-nav__title" for="nav-6">
|
||||
<label class="md-nav__title" for="nav-7">
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
Others
|
||||
</label>
|
||||
|
@ -871,6 +925,18 @@
|
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<li class="md-nav__item">
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||||
<a href="../../change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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</a>
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</li>
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Data Quality
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Features
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Citation
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@ -696,6 +696,60 @@
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Features
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</nav>
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@ -861,14 +915,14 @@
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Change Log
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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Citation
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@ -696,6 +696,60 @@
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Visualizations
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</label>
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Data Quality
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Features
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</li>
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</ul>
|
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</nav>
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</li>
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@ -705,14 +759,14 @@
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|
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Developers
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|
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</label>
|
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Change Log
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Citation
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@ -696,6 +696,60 @@
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Visualizations
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Data Quality
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Features
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@ -705,14 +759,14 @@
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Developers
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Developers
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@ -833,14 +887,14 @@
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@ -900,6 +954,18 @@
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Change Log
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Citation
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@ -696,6 +696,60 @@
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Data Quality
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@ -705,14 +759,14 @@
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@ -890,14 +944,14 @@
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@ -957,6 +1011,18 @@
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Change Log
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</li>
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Citation
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@ -706,11 +706,65 @@
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Visualizations
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|
||||
Data Quality
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|
||||
Features
|
||||
</a>
|
||||
</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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Developers
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|
||||
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Developers
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</label>
|
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|
@ -795,14 +849,14 @@
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Others
|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
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|
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|
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|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
|
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|
@ -977,6 +1031,18 @@
|
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||||
<li class="md-nav__item">
|
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|
||||
Change Log
|
||||
</a>
|
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</li>
|
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|
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<li class="md-nav__item">
|
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Citation
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@ -780,11 +780,65 @@
|
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Visualizations
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Visualizations
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Data Quality
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Features
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</ul>
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</nav>
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Developers
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Change Log
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Citation
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Next
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Remote Support
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Data Quality
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Data Quality
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Features
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Developers
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Developers
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@ -860,14 +914,14 @@
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Others
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@ -927,6 +981,18 @@
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Change Log
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</li>
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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Visualizations
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Data Quality
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Features
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Developers
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Developers
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</label>
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@ -835,14 +889,14 @@
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Others
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@ -902,6 +956,18 @@
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Change Log
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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|
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
|
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Visualizations
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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Data Quality
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|
||||
Features
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Developers
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Developers
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</label>
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@ -835,14 +889,14 @@
|
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|
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Others
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</label>
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||||
|
@ -902,6 +956,18 @@
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|
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Change Log
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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|
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Citation
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|
@ -748,11 +748,65 @@
|
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|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Visualizations
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</label>
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Data Quality
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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|
||||
Features
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</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Developers
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</label>
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
Developers
|
||||
</label>
|
||||
|
@ -835,14 +889,14 @@
|
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
|
||||
|
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|
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|
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Others
|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
||||
<nav class="md-nav" aria-label="Others" data-md-level="1">
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|
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|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
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Others
|
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</label>
|
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|
@ -902,6 +956,18 @@
|
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|
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<li class="md-nav__item">
|
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<a href="../../change-log/" class="md-nav__link">
|
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Change Log
|
||||
</a>
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</li>
|
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<li class="md-nav__item">
|
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<a href="../../citation/" class="md-nav__link">
|
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Citation
|
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@ -748,11 +748,65 @@
|
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Citation
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Data Quality
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Features
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@ -835,14 +889,14 @@
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Change Log
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Citation
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@ -755,11 +755,65 @@
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Data Quality
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Features
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</nav>
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Developers
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Developers
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@ -842,14 +896,14 @@
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@ -909,6 +963,18 @@
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Change Log
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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Data Quality
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Features
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Developers
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</label>
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@ -835,14 +889,14 @@
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Others
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@ -902,6 +956,18 @@
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Change Log
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</li>
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|
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
|
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|
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|
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Visualizations
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Data Quality
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|
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|
||||
Features
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</a>
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||||
</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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||||
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|
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Developers
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||||
</label>
|
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|
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|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
Developers
|
||||
</label>
|
||||
|
@ -835,14 +889,14 @@
|
|||
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|
||||
|
||||
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|
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|
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|
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
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|
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|
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||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
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Others
|
||||
</label>
|
||||
|
@ -902,6 +956,18 @@
|
|||
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||||
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||||
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||||
<li class="md-nav__item">
|
||||
<a href="../../change-log/" class="md-nav__link">
|
||||
Change Log
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||||
</a>
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||||
</li>
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<li class="md-nav__item">
|
||||
<a href="../../citation/" class="md-nav__link">
|
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Citation
|
||||
|
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|
@ -748,11 +748,65 @@
|
|||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
|
||||
|
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<label class="md-nav__link" for="nav-5">
|
||||
Visualizations
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
</label>
|
||||
<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
|
||||
<label class="md-nav__title" for="nav-5">
|
||||
<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
|
||||
Visualizations
|
||||
</label>
|
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|
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Change Log
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Change Log
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@ -835,14 +889,14 @@
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Change Log
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Features
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</ul>
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</nav>
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</li>
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Developers
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@ -835,14 +889,14 @@
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Others
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</label>
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||||
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@ -902,6 +956,18 @@
|
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Change Log
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</li>
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Citation
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Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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|
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Features
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</a>
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Change Log
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Change Log
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Data Quality
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Features
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Developers
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@ -835,14 +889,14 @@
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Change Log
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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@ -835,14 +889,14 @@
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@ -902,6 +956,18 @@
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Change Log
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</ul>
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</nav>
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</li>
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Developers
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</label>
|
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@ -835,14 +889,14 @@
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
|
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|
@ -902,6 +956,18 @@
|
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<li class="md-nav__item">
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Change Log
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</a>
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</li>
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Citation
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@ -748,11 +748,65 @@
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Data Quality
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|
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Features
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</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<label class="md-nav__title" for="nav-6">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Developers
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</label>
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@ -835,14 +889,14 @@
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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Others
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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@ -902,6 +956,18 @@
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../../change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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<li class="md-nav__item">
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Citation
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@ -717,11 +717,65 @@
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Visualizations
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Visualizations
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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Data Quality
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Features
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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<label class="md-nav__link" for="nav-6">
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Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Developers" data-md-level="1">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Developers
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</label>
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@ -804,14 +858,14 @@
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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Others
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Others
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</label>
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@ -871,6 +925,18 @@
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../citation/" class="md-nav__link">
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Citation
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@ -929,7 +995,7 @@
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<p>RAPIDS source code is saved in <code>src/</code>. The <code>src/data/</code> folder stores scripts to download, clean and pre-process sensor data, <code>src/features</code> has scripts to extract behavioral features organized in their respective sensor subfolders , <code>src/models/</code> can host any script to create models or statistical analyses with the behavioral features you extract, and <code>src/visualization/</code> has scripts to create plots of the raw and processed data. There are other files and folders but only relevant if you are interested in extending RAPIDS (e.g. virtual env files, docs, tests, Dockerfile, the Snakefile, etc.). </p>
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<p>In the figure below, we represent the interactions between users and files. After a user modifies the configuration files mentioned above, the <code>Snakefile</code> file will search for and execute the Snakemake rules that contain the Python or R scripts necessary to generate or update the required output files (behavioral features, plots, etc.).</p>
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<figure>
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<img src="../img/files.png" width="600" />
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<img src="../img/files.png" max-width="100%" />
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<figcaption>Interaction diagram between the user, and important files in RAPIDS</figcaption>
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</figure>
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After Width: | Height: | Size: 37 KiB |
After Width: | Height: | Size: 46 KiB |
After Width: | Height: | Size: 288 KiB |
After Width: | Height: | Size: 58 KiB |
After Width: | Height: | Size: 53 KiB |
|
@ -758,11 +758,65 @@
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|||
<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
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<label class="md-nav__link" for="nav-5">
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Visualizations
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
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<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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Data Quality
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<li class="md-nav__item">
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Features
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</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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<label class="md-nav__title" for="nav-6">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Developers
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</label>
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@ -845,14 +899,14 @@
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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Others
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</label>
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
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@ -912,6 +966,18 @@
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<li class="md-nav__item">
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<a href="change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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<li class="md-nav__item">
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<a href="citation/" class="md-nav__link">
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Citation
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@ -706,11 +706,65 @@
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-5" type="checkbox" id="nav-5" >
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<label class="md-nav__link" for="nav-5">
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||||
Visualizations
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Visualizations" data-md-level="1">
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<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Visualizations
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</label>
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<ul class="md-nav__list" data-md-scrollfix>
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<li class="md-nav__item">
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Data Quality
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</a>
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</li>
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<li class="md-nav__item">
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<a href="../visualizations/feature-visualizations/" class="md-nav__link">
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Features
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</a>
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</li>
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</ul>
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</nav>
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</li>
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<li class="md-nav__item md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" >
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<label class="md-nav__link" for="nav-6">
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||||
Developers
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Developers" data-md-level="1">
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<label class="md-nav__title" for="nav-5">
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<label class="md-nav__title" for="nav-6">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Developers
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</label>
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@ -795,14 +849,14 @@
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<li class="md-nav__item md-nav__item--active md-nav__item--section md-nav__item--nested">
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-6" type="checkbox" id="nav-6" checked>
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<input class="md-nav__toggle md-toggle" data-md-toggle="nav-7" type="checkbox" id="nav-7" checked>
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<label class="md-nav__link" for="nav-6">
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<label class="md-nav__link" for="nav-7">
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Others
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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</label>
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<nav class="md-nav" aria-label="Others" data-md-level="1">
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<label class="md-nav__title" for="nav-6">
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<label class="md-nav__title" for="nav-7">
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<span class="md-nav__icon md-icon"></span>
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Others
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</label>
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@ -871,6 +925,18 @@
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<li class="md-nav__item">
|
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<a href="../change-log/" class="md-nav__link">
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Change Log
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</a>
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</li>
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<a href="../citation/" class="md-nav__link">
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Citation
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